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理工学部 物質生命理工学科

Researcher List >> Kondo Jiro
 

Kondo Jiro

 
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NameKondo Jiro
URLhttps://jkondo.wixsite.com/sophia-biophysics
AffiliationSophia University
SectionFaculty of Science and Technology, Department of Materials and Life Sciences
Job titleAssociate Professor
Degree学士(工学)(立命館大学), 修士(理学)(東京工業大学), 博士(理学)(東京工業大学)
Research funding number10546576
J-Global ID200901072722483790

Profile

2001-2004: Tokyo Institute of Technology (Ph.D course)
"Structural studies of repetitive DNA sequences in the human genome"
2004-2010: Universite de Strasbourg (Postdoctoral researcher)
"Structural studies of the ribosomal RNA molecular switches"
2010-Present: Sophia University (Assistant Professor)
"Motion picture crystallography of DNA/RNA molecular switches"(Subject of research)
Structural studies on antibiotic-resistance mechanisms and their application to drug design
DNAを利用する重金属イオン除去膜、導電性ワイヤーの開発研究―構造、物性、応用
分子・励起分子・イオンの電子構造と反応・ダイナミックスの解明
ナンセンス突然変異型遺伝病に対するリードスルー治療薬のStructure-Based Design
「顧みられない熱帯病(NTDs)」治療を目的とした新規アミノグリコシド系抗原虫薬のStructure-Based Design
ナンセンス変異型遺伝性疾患への抗生物質の薬理メカニズムの解明と新規治療薬の開発
「顧みられない熱帯病」をターゲットとした新規フッ素化アミノグリコシド薬剤のStructure-Base Design
DNA-金属ハイブリッドナノワイヤー・ナノケージのStructure-Base Design
孵化酵素-基質複合体の3次元構造の解明
インフルエンザウイルスゲノムRNAの構造学的研究と新規インフルエンザ治療薬の開発
DNA二重鎖中で無限に金属イオンが連続する超分子錯体:精密合成・結晶構造・物性
DNAものづくりプラットフォームによるDNA医薬品の開発
放射光X線結晶解析とクライオ電子顕微鏡を融合した構造生物模倣科学の開拓
貴金属とDNAを融合させたバイオ・ナノデバイスのStructure-Based Design

Research Interests

 
X-Ray crystallography ,Drug resistance ,Antibiotics ,生体機能応用デバイス ,物理系薬学

Research Areas

 
  • Life sciences / Pharmaceuticals - analytical and physicochemistry / 
  • Life sciences / Biophysics / 
  • Life sciences / Structural biochemistry / 

Research History

 
Jan 2009
 - 
Mar 2010
Universite de Strasbourg  Postdoctoral fellow 
 
Apr 2006
 - 
Dec 2008
Universite Louis Pasteur  Postdoctoral fellow 
 
Apr 2004
 - 
Apr 2006
Universite Louis Pasteur  JSPS research fellow 
 

Education

 
Apr 2001
 - 
Mar 2004
Tokyo Institute of Technology Graduate School, Division of Life Science and Engineering 
 
Apr 2001
 - 
Mar 2004
Tokyo Institute of Technology Graduate School, Division of Life Science and Engineering 
 
Apr 1999
 - 
Mar 2001
Tokyo Institute of Technology Graduate School, Division of Life Science and Engineering 
 
Apr 1999
 - 
Mar 2001
Tokyo Institute of Technology Graduate School, Division of Life Science and Engineering 
 
Apr 1995
 - 
Mar 1999
Ritsumeikan University Faculty of Science and Engineering 
 

Awards

 
Mar 2022
Sophia University, Attractive Lecture Award 2020
 
Mar 2020
田中貴金属記念財団, 2019年度「貴金属に関わる研究助成金」奨励賞
Jiro Kondo 
 
Dec 2018
上智大学理工学部, Attractive Lecture Award 2018,生物物理学
 
Dec 2017
上智大学理工学部, Attractive Lecture Award 2017,基礎生物学
 
Apr 2015
Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology, The Commendation for Science and Technology by the Minister of Education, Culture, Sports, Science and Technology, The Young Scientists' Prize
Jiro Kondo 
 

Papers

 
 
Masashi Ota   Hiromi Takahashi   Yuhei Nogi   Yuma Kagotani   Noriko Saito-Tarashima   Jiro Kondo   Noriaki Minakawa   
Bioorganic & Medicinal Chemistry   76 117093-117093   Dec 2022   [Refereed]
 
Takahiro Atsugi   Akira Ono   Miho Tasaka   Natsumi Eguchi   Shoji Fujiwara   Jiro Kondo   
Angewandte Chemie International Edition   61    May 2022   [Refereed]
 
Jiro Kondo   
BIO INDUSTRY   39    2022   [Invited]
 
Jiro Kondo   
PHARM STAGE   22    2022   [Invited]
 
Cecilia Cerretani   Mikkel Liisberg   Vanessa Rück   Jiro Kondo   Tom Vosch   
Nanoscale Advances   published online    2022   [Refereed]
The effect of replacing guanosines with inosines in the two stabilizing strands (5’-CACCTAGCGA-3’) of the NIR emissive DNA-Ag16NC was investigated. The spectroscopic behavior of the inosine mutants is position-dependent: when...

Misc.

 
 
Jiro Kondo   
Bioindustry   35(3) 56-64   Mar 2018   [Invited]
 
67(11) 828-836   Nov 2016
 
Jiro Kondo   
Chemical Industry   27(11) 28-36   Nov 2016   [Invited]
 
Jiro Kondo   
SOPHIA SCI-TECH   27 2-7   Apr 2016   [Invited]
 
Jiro Kondo   
Bulletin of The RNA Society of Japan   (32) 12-14   May 2015   

Books and Other Publications

 
 
Akio Takenaka, Takashi Kumasaka, Tomoko Sunami, Toshiyuki Chatake, Ella Morishita(Part:Joint author)
2 Feb 2022   (ISBN:4621307061)
 
Kondo Jiro(Part:Others, p.30-40(1.4. 結晶解析))
講談社サイエンティフィク   22 Dec 2020   
 
1 Nov 2019   
DNAやRNAにみられる塩基対や水素結合を理解するための教育・研究用分子模型を作製した。
 
 
Kondo Jiro(Part:Others, 220)
The Crystallographic Society of Japan   31 Jul 2014   (ISBN:9784990386122)   

Presentations

 
 
近藤次郎   
第17回 ナノ・バイオメディカル学会大会   8 Nov 2022   [Invited]
 
Kaito Mizuno   Sekiguchi Sao   Asaki Hayasaka   Miki Nagashima   Jiro Kondo   
ISNAC2022   3 Nov 2022   
 
Yui Miyahara   Kohsei Sekiya   Jiro Kondo   Hidetaka Torigoe   
ISNAC2022   3 Nov 2022   
 
Chiharu Matsumoto   Jiro Kondo   
ISNAC2022   3 Nov 2022   
 
Moena Takahashi   Kana Kodaira   Jiro Kondo   
ISNAC2022   3 Nov 2022   

Professional Memberships

 
 
   
 
日本結晶学会
 
   
 
The RNA Society
 
   
 
日本RNA学会
 
   
 
日本化学会
 
   
 
日本生化学会

Research Projects

 
 
RNAターゲット創薬のためのRNA分子設計・共結晶化・試料調製支援と高度化
国立研究開発法人日本医療研究開発機構(AMED): 生命科学・創薬研究支援基盤事業(BINDS)
Project Year: Apr 2022 - Mar 2027
 
Nucleic Acid-Metal Complexes: Preparation, structure analysis, characterization of metal-DNA wires and metal nanocluster-DNA complexes.
Japan Society for the Promotion of Science: Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Project Year: Apr 2021 - Mar 2025
 
多彩な蛍光色を呈するDNA-銀ナノクラスターのX線結晶解析
高エネルギー加速器研究機構 物質構造科学研究所: 放射光共同利用実験
Project Year: Oct 2021 - Sep 2023
 
放射光X線結晶解析とクライオ電子顕微鏡を融合した構造生物模倣科学の開拓
上智大学: 上智大学学術研究特別推進費
近藤次郎 山田悠介 包明久 
Project Year: Apr 2020 - Mar 2023
 
リボソームRNAを模倣した一塩基多型センサーのStructure-Based Design
高エネルギー加速器研究機構 物質構造科学研究所: 放射光共同利用実験
Project Year: Oct 2020 - Sep 2022

Social Activities

 
 
 
 
[Others]
 Apr 2012 - Mar 2014
 
[Others]
 Apr 2011 - Mar 2013

Other

 
 
 
 
Sep 2019 - Sep 2019
(プレスリリース)16個の銀原子をDNAでコーティングしたナノ蛍光物質 「DNA-銀ナノクラスター」の 立体構造解析に成功
 
 
 
基礎生物化学、生活と化学