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理工学部 物質生命理工学科

研究者リスト >> 近藤 次郎
 

近藤 次郎

 
アバター
研究者氏名近藤 次郎
 
コンドウ ジロウ
URLhttps://jkondo.wixsite.com/sophia-biophysics
所属上智大学
部署理工学部物質生命理工学科
職名教授
学位学士(工学)(立命館大学), 修士(理学)(東京工業大学), 博士(理学)(東京工業大学)
科研費研究者番号10546576
J-Global ID200901072722483790

プロフィール

研究活動
X線結晶解析などの生物物理学的手法をつかってDNAやRNAといった核酸分子の「かたち」や「動き」を原子・分子レベルの目で観察し、それらの「働き」を明らかにする研究を行っています。これによって複雑な生命現象をより詳しく理解することが可能になります。さらに、これらの研究で得られた立体構造情報を活用・模倣して、遺伝病などの治療薬や診断薬、バイオナノマテリアルのデザイン・開発に取り組んでいきます。
 
教育活動:担当授業科目
基礎生物学、理工基礎実験、生物科学実験Ⅰ、生物物理学、卒業研究、Fundamental Biochemistry、Technology & Innovation - Career Development -、生物物理特論、生物科学ゼミナール、大学院演習
 
研究テーマ
・抗生物質に対する耐性メカニズムの分子構造論的研究と創薬への応用・DNAを利用する重金属イオン除去膜、導電性ワイヤーの開発研究―構造、物性、応用・分子・励起分子・イオンの電子構造と反応・ダイナミックスの解明・ナンセンス突然変異型遺伝病に対するリードスルー治療薬のStructure-Based Design・「顧みられない熱帯病(NTDs)」治療を目的とした新規アミノグリコシド系抗原虫薬のStructure-Based Design・ナンセンス変異型遺伝性疾患への抗生物質の薬理メカニズムの解明と新規治療薬の開発・「顧みられない熱帯病」をターゲットとした新規フッ素化アミノグリコシド薬剤のStructure-Base Design・DNA-金属ハイブリッドナノワイヤー・ナノケージのStructure-Base Design・孵化酵素-基質複合体の3次元構造の解明・インフルエンザウイルスゲノムRNAの構造学的研究と新規インフルエンザ治療薬の開発・DNA二重鎖中で無限に金属イオンが連続する超分子錯体:精密合成・結晶構造・物性・DNAものづくりプラットフォームによるDNA医薬品の開発・放射光X線結晶解析とクライオ電子顕微鏡を融合した構造生物模倣科学の開拓・貴金属とDNAを融合させたバイオ・ナノデバイスのStructure-Based Design

研究キーワード

 
X線結晶解析 ,薬剤耐性 ,抗生物質 ,生体機能応用デバイス ,物理系薬学

研究分野

 
  • ライフサイエンス / 薬系分析、物理化学 / 
  • ライフサイエンス / 生物物理学 / 
  • ライフサイエンス / 構造生物化学 / 

経歴

 
2023年4月
 - 
現在
上智大学 理工学部 物質生命理工学科 教授 
 
2015年4月
 - 
2023年3月
上智大学 理工学部 物質生命理工学科 准教授 
 
2010年4月
 - 
2015年3月
上智大学 理工学部 物質生命理工学科 助教 
 
2009年1月
 - 
2010年3月
ストラスブール大学  博士研究員 
 
2006年4月
 - 
2008年12月
ルイ・パスツール大学  博士研究員 
 

学歴

 
2001年4月
 - 
2004年3月
東京工業大学 生命理工学研究科 分子生命科学専攻
 
1999年4月
 - 
2001年3月
東京工業大学 生命理工学研究科 分子生命科学専攻
 
1995年4月
 - 
1999年3月
立命館大学 理工学部 生物工学科
 

受賞

 
2023年11月
日本感性工学会, かわいい感性デザイン賞,BasePairPuzzle
近藤次郎 中村昇太 
 
2022年3月
上智大学理工学部, Attractive Lecture Award 2020,基礎生物学
近藤次郎 
 
2020年3月
田中貴金属記念財団, 2019年度「貴金属に関わる研究助成金」奨励賞,貴金属とDNAを融合させたバイオ・ナノデバイスのStructure-Based Design
近藤次郎 
 
2018年12月
上智大学理工学部, Attractive Lecture Award 2018,生物物理学
 
2017年12月
上智大学理工学部, Attractive Lecture Award 2017,基礎生物学
 

論文

 
 
Vanessa Rück   Vlad A. Neacșu   Mikkel B. Liisberg   Christian B. Mollerup   Park Hee Ju   Tom Vosch   Jiro Kondo   Cecilia Cerretani   
Advanced Optical Materials   12(7) 2301928   2024年3月   [査読有り]
Abstract

The combination of mass spectrometry and single crystal X‐ray diffraction of HPLC‐purified DNA‐stabilized silver nanoclusters (DNA‐AgNCs) is a powerful tool to determine the charge and structure of the encapsulated AgNC. Such information...
 
近藤次郎   
実験医学増刊号   42(2) 129-135   2024年   [招待有り]
 
Anna Gonzàlez-Rosell   Sami Malola   Rweetuparna Guha   Nery R. Arevalos   María Francisca Matus   Meghen E. Goule   Esa Haapaniemi   Benjamin B. Katz   Tom Vosch   Jiro Kondo   Hannu Häkkinen   Stacy M. Cop   
Journal of the American Chemical Society      2023年5月   [査読有り]
 
Hidetaka Torigoe   Jiro Kondo   Fumihiro Arakawa   
Journal of Inorganic Biochemistry   241 112125-112125   2023年4月   [査読有り]
 
Jiro Kondo   Shota Nakamura   
Journal of Chemical Education   100(2) 946-954   2023年1月   [査読有り]

MISC

 
 
近藤次郎   
月刊バイオインダストリー   35(3) 56-64   2018年3月   [招待有り]
 
 
近藤次郎   
月刊化学工業   27(11) 28-36   2016年11月   [招待有り]
 
近藤次郎   
SOPHIA SCI-TECH 上智大学理工学振興会会報   27 2-7   2016年4月   [招待有り]
 
近藤次郎   
日本RNA学会会報   (32) 12-14   2015年5月   

書籍等出版物

 
 
近藤次郎(担当:分担執筆, 範囲:核酸医薬開発のためのX線結晶解析)
NTS   2024年4月   
 
竹中 章郎, 熊坂 崇, 近藤 次郎, 角南 智子, 茶竹 俊行, 森下 えら(担当:共著)
丸善出版   2022年2月2日   (ISBN:4621307061)
 
近藤 次郎(担当:その他, 範囲:p.30-40(1.4. 結晶解析))
講談社サイエンティフィク   2020年12月22日   
 
StudioMIDAS   2019年11月1日   
DNAやRNAにみられる塩基対や水素結合を理解するための教育・研究用分子模型を作製した。
 

講演・口頭発表等

 
 
近藤次郎   中村昇太   
日本化学会第104春季年会   2024年3月20日   
 
Jiro Kondo   Shota Nakamura   
ISNAC 2023 (The 50th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry)   2023年11月2日   
 
近藤次郎   
CBI学会2023年大会   2023年10月25日   [招待有り]
 
近藤次郎   
第2回 BINDS公開講座   2023年9月29日   
 
Jiro Kondo   Akira Sato   Moena Takahashi   Yusuke Inoue   
IUCr 2023 (26th Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography)   2023年8月26日   

所属学協会

 
 
   
 
日本結晶学会
 
   
 
The RNA Society
 
   
 
日本RNA学会
 
   
 
日本化学会
 
   
 
日本生化学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

 
 
RNAターゲット創薬のためのRNA分子設計・共結晶化・試料調製支援と高度化
国立研究開発法人日本医療研究開発機構(AMED): 生命科学・創薬研究支援基盤事業(BINDS)
研究期間: 2022年4月 - 2027年3月
 
核酸-金属複合体の合成・構造・機能:DNA超分子錯体と蛍光性Agナノクラスター
日本学術振興会: 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
小野 晶 近藤 次郎 山田 亮 田中 好幸 鳥越 秀峰 大樂 武範 藤原 章司 
研究期間: 2021年4月 - 2025年3月
 
多彩な蛍光色を呈するDNA-銀ナノクラスターのX線結晶解析
高エネルギー加速器研究機構 物質構造科学研究所: 放射光共同利用実験
研究期間: 2021年10月 - 2023年9月
 
放射光X線結晶解析とクライオ電子顕微鏡を融合した構造生物模倣科学の開拓
上智大学: 上智大学学術研究特別推進費
近藤次郎 山田悠介 包明久 
研究期間: 2020年4月 - 2023年3月
 
リボソームRNAを模倣した一塩基多型センサーのStructure-Based Design
高エネルギー加速器研究機構 物質構造科学研究所: 放射光共同利用実験
研究期間: 2020年10月 - 2022年9月

社会貢献活動

 
 
【その他】
 2021年1月1日
 
 
【その他】
 2012年4月 - 2014年3月
 
【その他】
 2011年4月 - 2013年3月

その他

 
 
オリジナル分子模型「BasePairPuzzle」を用いたアクティブラーニングを高校生を対象に行った。
 
 
オリジナル分子「BasePairPuzzle」を用いて、アクティブラーニングを高校生対象に行った。
 
 
2019年9月 - 2019年9月
(プレスリリース)16個の銀原子をDNAでコーティングしたナノ蛍光物質 「DNA-銀ナノクラスター」の 立体構造解析に成功
 
 
 
基礎生物化学、生活と化学