南部伸孝

ナンブシンコウ (Nambu Shinkoh)

基本情報

所属: 上智大学理工学部物質生命理工学科教授

学位: 博士（理学）(1994年4月慶應義塾大学)

連絡先: shinkoh.nanbusophia.ac.jp
通称等の別名: Shinkoh NANBU
研究者番号: 00249955
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-8502-3193
J-GLOBAL ID: 200901062366264730
researchmap会員ID: 1000144738

研究経歴
1988年4月ー1994年3月
慶應義塾大学理工学部化学科，岩田末廣教授の指導のもと，電子励起状態の研究とともに核の運動に関する理論的研究を実施
1994年4月ー1997年3月
分子研理論研究系分子基礎理論第二，中村宏樹教授および，カナダのWaterloo大学，F. O. Goodman教授とともに共同研究を行い，非断熱遷移に特有な現象を利用した分子スイッチの可能性について提案
1995年9月ー2002年3月
計算科学研究センター，青柳睦前助教授（現在は，九州大学　情報基盤センター教授）とともに分子の高振動励起状態の研究を実施
1999年6月ー1999年12月
米国イリノイ州アルゴンヌ国立研究所にて訪問研究員として従事し，理論化学部門Stephen K. Gray教授のもと，多原子分子への応用が可能である遷移状態波束動力学計算の開発を実施
1994年4月ー現在
素反応過程の研究を中心に電子励起状態と反応動力学の研究を実施。特に，多自由度系への新展開を目指しプログラム開発を実施。一方，スーパーコンピュータの能力を活用し，機能分子，タンパク質の機能及び生理活性分子の探索を実施

大学での学事関連
2015年ー2016年　上智大学大学院　理工学研究科　理工学専攻　化学領域主任
2012年ー2013年　上智大学大学院　学務委員会委員（理工委員）
2010年ー2012年　上智大学大学院　理工学研究科　理工学専攻　化学領域主任
2012年　理工学部　推進委員
2012年ー現在　地球環境研究所員
2025年　理工学部物質生命理工学科　予算委員
2026年ー　クラス担任

研究テーマ
化学反応に見出される非断熱現象の解明と応用　ー物質の機能発現と反応制御
光に応答する分子の非断熱動力学シミュレーション
温暖化関連ガス循環解析のアイソトポマーによる高精度化
アイソトポマーの計測・解析技術開発による物質循環解析
生体分子の構造と光応答の相関に対する非断熱遷移動力学法によるアプローチ

共同・受託研究テーマ
フォトクロミック現象の理論的解明と応用
肝細胞造影能を持つ副作用軽減型X線用診断薬の開発
柔軟性結晶（プラスチッククリスタル）・電解質溶液の分子論的理論解析

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

2019年9月

BCSJ(Bulletin of the Chemical Society Japan：日本化学会欧文誌）賞 Theoretical Molecular Dynamics Simulation of the DIF-1 Receptor Activation 日本化学会

Jiang Tianlong, Tamao Saito, Shinkoh Nanbu
2017年10月

Prizes for posters at QSCP-XXII was sponsored by Physical Chemistry Chemical Physics (PCCP), a journal published by the Royal Society of Chemistry. China the Royal Society of Chemistry

Tianlong JIANG, Kenta MORIWAKI, Osamu KOBAYASHI, S. O. DANIELACHE, S. NANBU

論文

140

H atom-induced oxidation reaction on water-terminated Si surface, 2H+H2O/Si(100)-(2x1): A theoretical study

H Watanabe, ZH Wang, S Nanbu, J Maki, T Urisu, M Aoyagi, K Ooi

CHEMICAL PHYSICS LETTERS 412(4-6) 347-352 2005年9月査読有り
Fabrication of avidin single molecular layer on silicon oxide surfaces and formation of tethered lipid bilayer membranes

R. Tero, N. Misawa, H. Watanabe, S. Yamamura, SHINKOH NANBU, Y. Nonogaki, T. Urisu

e-Journal of Surface Science and Nanotechnology 3(9) 237-243 2005年6月査読有り

Single molecular layer of avidin is fabricated on an atomically flat SiO₂ surface and characterized by atomic force microscopy (AFM) and infrared reflection absorption spectroscopy. Immobilization of avidin is performed as follows; i) ester-modification of the surface by silane-coupling agent, ii) carboxylation by hydrolysis in HCl and iii) amide bonding between the surface -COOH and -NH₂ in avidin molecules. Large dome structures (∼60 nm height) are formed after the ester-modification, but an atomically flat surface is obtained after the hydrolysis reaction. AFM topographs and function-recognizing images show that the each of avidin molecules adsorbs as a single molecule and retains the biotin-binding activity. Formation of a tethered bilayer membrane of a biotinylated phospholipid on the avidin layer is also described. [DOI: 10.1380/ejssnt.2005.237]
Ab initio calculated structures of conformers for 1,3-dimethoxy-p-tert-butylcalix[4]crown-5-ether complexed with potassium cation

JI Choe, SK Chang, S Lee, S Nanbu

JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE-THEOCHEM 722(1-3) 117-123 2005年5月査読有り
Vibrational energies for the (X)over-tilde(1)A(1), (A)over-tilde(1)B(1), and B(1)A(1) states of SiH2/SiD2 and related transition probabilities based on global potential energy surfaces

Tokue, I, K Yamasaki, S Nanbu

JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 122(14) 144307-144316 2005年4月査読有り
Theoretical transition probabilities for the (A)over-tilde(2)A(1)-(N)over-tilde(2)B(1) system of H2O+ and D2O+ and related Franck-Condon factors based on global potential energy surfaces

K Tokue, K Yamasaki, S Minamino, S Nanbu

JOURNAL OF THEORETICAL & COMPUTATIONAL CHEMISTRY 4(1) 225-245 2005年3月査読有り
Assignment of surface IR absorption spectra observed in the oxidation reactions: 2H+H2O/Si(100) and H2O+H/Si(100)

ZH Wang, T Urisu, H Watanabe, K Ooi, GR Rao, S Nanbu, J Maki, M Aoyagi

SURFACE SCIENCE 575(3) 330-342 2005年2月査読有り
A theoretical study of cyclohexadiene/hexatriene photochemical interconversion: multireference configuration interaction potential energy surfaces and transition probabilities for the radiationless decays

H Tamura, S Nanbu, H Nakamura, T Ishida

CHEMICAL PHYSICS LETTERS 401(4-6) 487-491 2005年1月査読有り
Analysis of the ultraviolet absorption cross sections of six isotopically substituted nitrous oxide species using 3D wave packet propagation

S Nanbu, MS Johnson

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A 108(41) 8905-8913 2004年10月査読有り筆頭著者責任著者
Ab initio study of the complexation behavior of p-tert-butylcalix[5]arene derivative toward alkyl ammonium cations

JI Choe, SH Lee, DS Oh, SK Chang, S Nanbu

BULLETIN OF THE KOREAN CHEMICAL SOCIETY 25(2) 190-194 2004年2月査読有り
Special issue: Quantum Chemistry Literature Database.

H Hosoya, S Yamabe, K Hashimoto, N Koga, T Matsushita, H Matsuzawa, S Minamino, U Nagashima, S Nanbu, T Nishikawa, K Takano, H Wasada, S Yabushita, S Yamamoto, K Morokuma, K Ohno, M Hada, K Honda, S Iwata, H Kashiwagi, S Nagase, H Nakatsuji, T Noro, S Obara, S Okazaki, Y Osamura, K Tanaka, K Yamashita

JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE-THEOCHEM 669 2004年2月査読有り
Three-pairs of doublet bands assigned to SiH2 scissoring modes observed in H2O-induced oxidation of Si(100) surfaces

Zhi-Hong Wang, Tsuneo Urisu, Shinkoh Nanbu, Jun Maki, G. Ranga Rao, Mutsumi Aoyagi, Hidekazu Watanabe, Kenta Ooi

Physical Review B - Condensed Matter and Materials Physics 69(4) 2004年1月21日査読有り
Theoretical analysis of the oxygen insertion process in the oxidation reactions of H2O+H/Si(100) and 2H+H2O/Si(100): a molecular orbital calculation and an analysis of tunneling reaction

H Watanabe, S Nanbu, ZH Wang, J Maki, T Urisu, M Aoyagi, K Ooi

CHEMICAL PHYSICS LETTERS 383(5-6) 523-527 2004年1月査読有り
Three-pairs of doublet bands assigned to SiH2 scissoring modes observed in H2O-induced oxidation of Si(100) surfaces

Zhi-Hong Wang, Tsuneo Urisu, Shinkoh Nanbu, Jun Maki, G. Rao, Mutsumi Aoyagi, Hidekazu Watanabe, Kenta Ooi

Physical Review B 69(4) 045309 2004年1月査読有り
He*(23S) penning ionization of H2S. II. Formation of the SH+(A3∏) and H2S +(Ã2A1) ions

Ikuo Tokue, Katsuyoshi Yamasaki, Shinkoh Nanbu

The Journal of chemical physics 119(12) 5882-5888 2003年9月査読有り
He*(2 3S) Penning ionization of H2S. I. Theoretical Franck–Condon factors for the H2S(X 1A1,v'=0)→H2S+(X 2B1,Ã 2A1) ionization and H2S+(Ã–X) transition

Tokue Ikuo, Yamasaki Katsuyoshi, Nanbu Shinkoh

Journal of chemical physics 119(12) 5874-5881 2003年9月査読有り
Theoretical study of vibrational spectra of p-tert-butylcalix[4]crown-6-ether complexed with ethyl ammonium cation

S Minamino, JI Choe, SK Chang, F Mizutani, S Nanbu

CHEMICAL PHYSICS LETTERS 374(5-6) 572-576 2003年6月査読有り責任著者
Ab initio study of the complexation behavior of calix[5]arene derivative toward alkyl ammonium cations

JI Choe, SK Chang, M Satoshi, S Nanbu

BULLETIN OF THE KOREAN CHEMICAL SOCIETY 24(1) 75-80 2003年1月査読有り
Theoretical Studies on Electronic Structure and Dynamics of Electronically Excited States

NANBU SHINKOH

Annual Review 2004 145-146 2003年1月査読有り筆頭著者
Chemical reactions in the O(1D) + HCl system III. Quantum dynamics on the excited (11A'', and 21A') potential energy surfaces

Hideyuki Kamisaka, Hiroki Nakamura, Shinkoh Nanbu, Mutsumi Aoyagi, Wensheng Bian, Kiyoshi Tanaka

Journal of Theoretical and Computational Chemistry 1(2) 285-293 2002年10月査読有り
Chemical reactions in the O(1D) + HCl system II. Dynamics on the ground 11 A' state and contributions of the excited (11A'', and 21A') states

KAMISAKA HIDEYUKI, NAKAMURA HIROKI, NANBU SHINKOH, AOYAGI MUTSUMI, BIAN WENSHENG, TANAKA KIYOSHI

Journal of Theoretical and Computational Chemistry 1(2) 275-284 2002年10月査読有り
Chemical reactions in the O(1D) + HCl system I. Ab initio global potential energy surfaces for the 11A’, 21A’, and 11A'' states

NANBU SHINKOH, AOYAGI MUTSUMI, KAMISAKA HIDEYUKI, NAKAMURA HIROKI, BIAN WENSHENG, TANAKA KYOSHI

Journal of Theoretical and Computational Chemistry 1(2) 263-273 2002年10月査読有り
Millimeter-wave spectroscopy of the internal-rotation band of the He-HCN complex and the intermolecular potential energy surface

Harada, K., Tanaka, K., Tanaka, T., Nanbu, S., Aoyagi, M.

Journal of Chemical Physics 117(15) 7041-7050 2002年7月査読有り
Formation of HCl+(A2Σ+) and HBr+(A2Σ+) Resulting from He(23S) Penning Ionization of HCl and HBr

Ikuo Tokue, Hiroyuki Tanaka, Katsuyoshi Yamasaki, Shinkoh Nanbu

The Journal of Physical Chemistry A 106(25) 6068-6074 2002年6月査読有り
Ab initio study of conformers of p-tert-butylcalix[4]crown-6-ether complexed with alkyl ammonium cations

JI Choe, SK Chang, S Nanbu

BULLETIN OF THE KOREAN CHEMICAL SOCIETY 23(6) 891-895 2002年6月査読有り
Assignment of the in-plane molecular vibrations of the electron-donor molecule BDT-TTP based on polarized Raman and infrared spectra, in which BDT-TTP is 2,5-bis(1,3-dithiol-2-ylidene)-1,3,4,6-tetrathiapentalene

J Ouyang, K Yakushi, T Kinoshita, N Nanbu, M Aoyagi, Y Misaki, K Tanaka

SPECTROCHIMICA ACTA PART A-MOLECULAR AND BIOMOLECULAR SPECTROSCOPY 58(8) 1643-1656 2002年6月査読有り
Ab initio study of p-tert-butylcalix[4]crown-6-ether complexed with alkyl ammonium cations

JI Choe, SK Chang, SW Ham, S Nanbu, M Aoyagi

BULLETIN OF THE KOREAN CHEMICAL SOCIETY 22(11) 1248-1254 2001年11月査読有り
Nuclear motion driven by the Renner-Teller effect as observed in the resonant Auger decay to the X̃²Π electronic ground state of N<inf>2</inf>O⁺

Miron, C., Simon, M., Morin, P., Nanbu, S., Kosugi, N., Sorensen, S.L., Naves De Brito, A., Piancastelli, M.N., Bj{\"o}rneholm, O., Feifel, R., B, a}ssler, M., Svensson, S.

Journal of Chemical Physics 115(2) 864-868 2001年1月査読有り
A comparative study of the quantum dynamics and rate constants of the O(P-3)+HCl reaction described by two potential surfaces

S Skokov, T Tsuchida, S Nanbu, JM Bowman, SK Gray

JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 113(1) 227-236 2000年7月査読有り
Theoretical study of the potential energy surfaces and bound states of HCP

S Nanbu, SK Gray, T Kinoshita, M Aoyagi

JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 112(13) 5866-5876 2000年4月査読有り筆頭著者
A theoretical study on vibrational spectra of C-84 fullerenes: results for C-2, D-2, and D-2d isomers

T Nishikawa, T Kinoshita, S Nanbu, M Aoyagi

JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE-THEOCHEM 461 453-461 1999年4月査読有り
Nonadiabatic bending dissociation in 16 valence electron system OCS

T Suzuki, H Katayanagi, S Nanbu, M Aoyagi

JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 109(14) 5778-5794 1998年10月査読有り
Molecular switching in one-dimensional finite periodic nonadiabatic tunneling potential systems

S Nanbu, H Nakamura, FO Goodman

JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 107(14) 5445-5459 1997年10月査読有り筆頭著者
Theoretical study of the potential energy surfaces and dynamics of CaNC/CaCN

S Nanbu, S Minamino, M Aoyagi

JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 106(19) 8073-8083 1997年5月査読有り筆頭著者
POTENTIAL-ENERGY SURFACES OF SOME LOW-LYING STATES OF FLUOROFORMYL RADICAL FCO

S NANBU, M GOMYO, S IWATA

CHEMICAL PHYSICS 184(1-3) 97-106 1994年6月査読有り筆頭著者
スーパーコンピュータの性能 : 計算化学の立場から

長嶋雲兵, 南部伸孝, 西本史雄, 福島伸弘

情報処理学会研究報告. [ハイパフォーマンスコンピューティング] 93(33) 29-36 1993年4月
THE EXCIMER EMISSION-SPECTRA AND THE INTERACTION POTENTIAL-ENERGY OF THE GROUND AND EXCITED-STATES OF HE AND ALKALI-METAL ION SYSTEMS

M HIYAMA, S NANBU, S IWATA

CHEMICAL PHYSICS LETTERS 192(5-6) 443-450 1992年5月査読有り
THEORETICAL-STUDY OF THE PHOTODISSOCIATION CROSS-SECTIONS AND THE PHOTODISSOCIATION DYNAMICS OF HOCL

S NANBU, S IWATA

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY 96(5) 2103-2111 1992年3月査読有り筆頭著者
Theoretical studies of vacuum ultraviolet emission spectra of NeLi + and ArLi+

Suehiro Iwata, Shinkoh Nanbu, Hideki Kitajima

The Journal of Chemical Physics 94(5) 3707-3714 1991年査読有り
THEORETICAL-STUDY OF THE PHOTOABSORPTION CROSS-SECTIONS OF HOCL AND HOF

S NAMBU, K NAKATA, S IWATA

CHEMICAL PHYSICS 135(1) 75-83 1989年7月査読有り
THEORETICAL EMISSION-SPECTRA OF NEAL+ AND ARAL+ IN THE VACUUM ULTRAVIOLET REGION

N SATO, S NANBU, S IWATA

CHEMICAL PHYSICS LETTERS 146(3-4) 275-279 1988年5月査読有り

MISC

糖認識機能を持つボロン酸型蛍光プローブ中の光誘起電子移動の解明

杉山数馬, 吉永竜平, 橋本剛, 南部伸孝, 早下隆士, 欅田英之, 江馬一弘

応用物理学会春季学術講演会講演予稿集(CD-ROM) 67th 2020年
ナフタレン骨格を持つボロン酸誘導体における光化学反応と溶媒効果

羽根田涼, 杉山数馬, 藤澤真友子, 欅田英之, 江馬一弘, 橋本剛, 早下隆士, 南部伸孝

分子科学討論会講演プログラム&要旨(Web) 12th 2018年
Clarification of nonadiabatic chemical dynamics by the Zhu-Nakamura theory of nonadiabatic transition: from tri-atomic systems to reactions in solutions

Toshimasa Ishida, Shinkoh Nanbu, Hiroki Nakamura

INTERNATIONAL REVIEWS IN PHYSICAL CHEMISTRY 36(2) 229-285 2017年査読有り招待有り責任著者
演算子変換に基づく効率的な時間発展法の開発

赤間知子, 小林理, 南部伸孝, 武次徹也

ケモインフォマティクス討論会予稿集 2016 P10 2016年

時間依存Schr&ouml;dinger方程式やその近似式は、実時間発展により超高速現象である電子ダイナミクスを記述できる。しかし、これらの時間微分方程式を解くための時間発展の計算は、高いコストを要することが多く、これまで適用が限られていた。一方、核波束ダイナミクスの分野では、Chebyshev多項式の3項間漸化式を用いて時間発展を行う実核波束発展法が開発され、計算コストの大幅な削減に成功している。そこで本研究では、実核波束発展法を参考に、効率的な時間発展法として3項間漸化式(3TRR)法を開発した。3TRR法では、演算子変換の導入によって導かれる3項間漸化式を用いて、変換されたエネルギー・時間軸上で効率的に計算を行う。元のエネルギーと時間を得るのに必要な逆変換の式の導出も行った。3TRR法を、電子ダイナミクスを記述するRT-TDHF/TDDFT計算に適用し、計算の効率化を目指した。
Future perspectives of nonadiabatic chemical dynamics

Shinkoh Nanbu, Toshimasa Ishida, Hiroki Nakamura

CHEMICAL SCIENCE 1(6) 663-674 2010年査読有り招待有り筆頭著者責任著者

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書籍等出版物

Semiclassical Molecular Dynamics Simulation Method

(担当:共著)

2026年12月 (ISBN: 9789811266348)
Intersystem crossing reaction for fluorescent 10-methyl-9(10H)- acridone via dioxetanone intermediates: on-the-fly nonadiabatic ONIOM molecular dynamics with particle mesh Ewald method and thermodynamics simulations

(担当:共著)

2023年1月 (ISBN: 9789814968423)
最近の研究から溶液内光異性化反応における化学動力学

南部伸孝

日本物理学会誌 2018年2月1日 Refereed
新著紹介「量子化学で生命の謎を解く」

南部伸孝

日本物理学会誌 2017年12月1日 Refereed
Clarification of Nonadiabatic Chemical Dynamics by the Zhu-Nakamura Theory of Nonadiabatic Transition: From Triatomic Systems to Reactions in Solutions

南部伸孝 (担当:共著)

International Reviews in Physical Chemistry, Taylor & Francis 2017年3月9日 Refereed

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講演・口頭発表等

258

S1電子状態を経由した3,5-dimethylisoxazoleの光異性化反応における非断熱 ab initio 化学動力学

木村美都稀, 南部伸孝

日本化学会第105春季年会（2025） 2025年3月29日
物理モデルシミュレーションにおける相同性検索

木村美都稀, 南部伸孝

第47回ケモインフォマティクス討論会 2024年12月17日
凝縮相における非断熱分子動力学シミュレーションの開発と応用

南部伸孝

第47回ケモインフォマティクス討論会 2024年12月17日
S1電子状態を経由する3,5-dimethylisoxazoleの光異性化反応に関する非断熱ab initio分子動力学解析

木村美都稀, 南部伸孝

第24回大つくばセミナー（2024） 2024年12月8日
分子衝突理論およびそれを用いたシミュレーションプログラムの開発と, N+H_3^+衝突反応への応用

大坪隼人, 南部伸孝

第18回分子科学討論会 2024年9月18日

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所属学協会

2019年3月 - 現在

理論化学会
- 現在

日本化学会
- 現在

日本物理学会
- 現在

分子科学会
- 現在

American Chemical Society

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共同研究・競争的資金等の研究課題

肝細胞造影能を持つ新規X線造影剤の特性検討

日本学術振興会科学研究費助成事業 2021年4月 - 2024年3月

松本伸行, 鈴木由美子, 南部伸孝
星間分子雲における低温イオン化学研究の新展開

日本学術振興会平成 30 年度科学研究費助成事業 2018年4月 - 2023年3月

岡田邦宏
アイソトポログによる地球表層環境診断

文部科学省平成 29 年度科学研究費助成事業 2017年4月 - 2022年3月
免疫測定に係る化学発光反応ダイナミクスと発光効率の革新的最適化

日本学術振興会平成 30 年度科学研究費助成事業 2018年4月 - 2021年3月

南部伸孝
人工葉の創成とその光化学変換

上智大学学術研究特別推進費「重点領域研究」 2018年4月 - 2021年3月

下村和彦

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社会貢献活動

同位体科学会副会長

その他

2015年4月1日 - 2017年3月31日
第28回化学反応討論会

その他

座長 2012年6月6日 - 2012年6月8日
World Fusion社（http://www.w-fusion.com/J/）と共同研究を実施する

その他

（2006年～）システム生物学による得られる個別の遺伝子，蛋白質について蓄積されたデータベース情報（配列，立体構造と注釈情報，文献情報）等により低次元の情報をネットワーク情報としてマップすることにより実体に近づけるバイオインフォマティクスと，分子の実体に止まりながら研究を行う我々分子科学者の架け橋を探る共同研究を始める．（2008年より，先端研究施設共用イノベーション創出事業へ発展し，約10万リガンド分子を用いた膨大なドッキングデータから薬として可能性のあるデータマイニングする発見的手法の提案を目指している．） 2006年1月 - 2011年3月
理論・計算分子科学コミュニティ懇談会ワーキンググループ委員

その他

2008年4月1日 - 2009年3月31日
サイエンティフィック・システム研究会（SS研究会・富士通，http://www.ssken.gr.jp/ index.shtml）正会員（九州大学代表，兼業）となる．

その他

ハイ・パフォーマンス・コンピューティング（HPC）分科会において，ペタスケール時代のコンピュータ技術開発（分子科学分野関連）を富士通と共同で研究を開始する．（自作の量子化学プログラムで性能の評価を開始する．） 2007年4月 - 2009年3月

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南部 伸孝

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

社会貢献活動

南部伸孝